有一天,大雄撿回了一棵小樹苗,利用哆啦A夢的「植物自動化液」令樹苗急速生長和懂得思想行動,並稱其為「樹寶」,樹寶因此成為大家的一份子。某天大家在後山正玩得十分開心之際,突然被一個綠色的不明幽浮帶走,因而來到了綠之星球。大雄等人被帶至星球的一個會議聆訊,會議上聖地的莉蕾公主和其手下希拉提出有感地球不斷受到污染,讓綠油油的樹急速消失。故此綠之星的莉蕾公主準備率領士兵一起將破壞樹木的地球人毀滅。植物星的長老勸止不成功,故決此將「綠之心」交給樹寶,因他相信樹寶有像綠之巨人般想保護大家的精神,故此就算他變成了綠之巨人也不會做壞事。之後,大雄等人嘗試回到地球後,發現一切已被植物覆蓋著,不過他們發現之前被幽浮吸走前,哆啦A夢的「定時器」從四次元百寶袋中掉下來並啟動了,即地球在被植物覆蓋之前已處於停頓狀態中,故地球人還沒有因植物覆蓋而死。當然希拉發現時間被停止的問題,故游說公主馬上讓綠之巨人甦醒過來。樹寶從莉蕾公主身邊逃脫後,準備回到大雄身邊,卻發現一個自己以前玩的玩具被植物星的力量摧毀了,想起從前的朋友們,十分激動和憤怒,樹寶故變成了傳說中擁有「足以破壞地球的力量」的綠之巨人.................